Годината е 1805 - времето на Наполеоновите войни. Място на действието – кораб от флотата на Нейно Величество. Филмът разказва за необикновеното приятелство между капитан Джак Обри и доктор Стивън Матюрин (традиционни герои от романите на Патрик О’Брайън). Джак e брилянтен мореплавател и воин - темпераментен, шумен, майстор на неприличните шеги. Стивън е отличен военен лекар, естество-изпитател и непохватен моряк, но с кураж, не по-малък от този на Джак. Докато преследват вражески френски кораб, те преживяват морски бури, справят се с жестоки наранявания, превъзмогват обстрели с топове и участват в зрелищни ръкопашни боеве, а в редките часове на усамотение търсят близкия път към приятелството... Забележително е участието на младшите офицери - 10-12 годишни хлапета, които са в центъра на бурните премеждия, отвели героите до далечния край на света. От хвърчащите при атаката трески от палубата и пълното безветрие в жегата, до обиколката на нос Хорн по време на свирепа буря, “Господар и командир” ще ви накара да се почувствате в морето, както в никой филм досега.